Акватория заказника «Лебяжий» представляет собой мелководную зону вдоль южного побережья восточной части Финского залива и входит в эстуарий реки Невы. В нее впадают две реки Черные, река Лебяжья и сток из озера Горовалдайского. На территории заказника обнаружено 5 видов амфибий, 3 вида рептилий, более 30 видов млекопитающих и свыше 150 видов птиц. Территория заказника включена в Список водно-болотных угодий международного значения с названием «Южное побережье Финского залива Балтийского моря в пределах государственного заказника «Лебяжий» (Ленинградская область)».
